Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LYNP07948 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LYNP07948 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LYNP07948 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LYNP07948 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LYNP07948 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LYNP07948 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LYNP07948 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LYNP07948 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LYNP07948 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LYNP07948 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LYNP07948 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LYNP07948 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LYNP07948 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LYNP07948 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LYNP07948 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LYNP07948 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LYNP07948 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LYNP07948 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LYNP07948 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LYNP07948 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LYNP07948 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LYNP07948 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LYNP07948 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LYNP07948 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LYNP07948 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LYNP07948 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LYNP07948 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LYNP07948 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LYNP07948 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LYNP07948 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LYNP07948 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LYNP07948 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LYNP07948 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LYNP07948 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LYNP07948 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LYNP07948 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LYNP07948 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LYNP07948 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LYNP07948 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LYNP07948 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LYNP07948 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LYNP07948 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LYNP07948 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LYNP07948 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LYNP07948 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LYNP07948 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LYNP07948 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LYNP07948 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LYNP07948 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LYNP07948 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LYNP07948 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LYNP07948 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LYNP07948 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LYNP07948 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LYNP07948 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LYNP07948 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LYNP07948 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LYNP07948 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LYNP07948 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LYNP07948 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LYNP07948 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LYNP07948 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LYNP07948 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LYNP07948 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LYNP07948 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LYNP07948 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LYNP07948 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LYNP07948 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LYNP07948 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LYNP07948 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LYNP07948 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LYNP07948 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LYNP07948 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LYNP07948 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LYNP07948 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LYNP07948 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LYNP07948 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LYNP07948 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LYNP07948 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LYNP07948 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LYNP07948 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LYNP07948 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LYNP07948 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LYNP07948 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LYNP07948 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LYNP07948 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LYNP07948 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LYNP07948 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LYNP07948 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LYNP07948 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LYNP07948 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LYNP07948 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LYNP07948 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LYNP07948 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LYNP07948 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LYNP07948 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LYNP07948 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LYNP07948 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LYNP07948 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms