Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSN3P07498 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSN3P07498 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSN3P07498 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSN3P07498 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSN3P07498 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSN3P07498 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSN3P07498 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSN3P07498 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSN3P07498 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSN3P07498 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSN3P07498 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSN3P07498 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSN3P07498 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSN3P07498 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSN3P07498 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSN3P07498 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSN3P07498 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSN3P07498 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSN3P07498 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSN3P07498 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSN3P07498 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSN3P07498 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSN3P07498 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSN3P07498 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSN3P07498 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSN3P07498 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSN3P07498 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSN3P07498 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSN3P07498 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSN3P07498 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSN3P07498 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSN3P07498 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSN3P07498 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSN3P07498 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSN3P07498 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CSN3P07498 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSN3P07498 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSN3P07498 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSN3P07498 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSN3P07498 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSN3P07498 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSN3P07498 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSN3P07498 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSN3P07498 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSN3P07498 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSN3P07498 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSN3P07498 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSN3P07498 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSN3P07498 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSN3P07498 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSN3P07498 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSN3P07498 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSN3P07498 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSN3P07498 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSN3P07498 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSN3P07498 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSN3P07498 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSN3P07498 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSN3P07498 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSN3P07498 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSN3P07498 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSN3P07498 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSN3P07498 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSN3P07498 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSN3P07498 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSN3P07498 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSN3P07498 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSN3P07498 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSN3P07498 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSN3P07498 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSN3P07498 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSN3P07498 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CSN3P07498 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CSN3P07498 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSN3P07498 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CSN3P07498 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSN3P07498 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CSN3P07498 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSN3P07498 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSN3P07498 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSN3P07498 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSN3P07498 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSN3P07498 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSN3P07498 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSN3P07498 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSN3P07498 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSN3P07498 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSN3P07498 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSN3P07498 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSN3P07498 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSN3P07498 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSN3P07498 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSN3P07498 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSN3P07498 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSN3P07498 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSN3P07498 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSN3P07498 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSN3P07498 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSN3P07498 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms