Protein–RNA interactions for Protein: P04179

SOD2, Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD2P04179 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOD2P04179 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOD2P04179 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOD2P04179 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOD2P04179 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOD2P04179 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOD2P04179 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOD2P04179 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOD2P04179 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOD2P04179 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SOD2P04179 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOD2P04179 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SOD2P04179 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOD2P04179 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOD2P04179 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOD2P04179 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOD2P04179 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOD2P04179 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOD2P04179 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOD2P04179 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOD2P04179 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOD2P04179 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOD2P04179 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOD2P04179 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOD2P04179 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SOD2P04179 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOD2P04179 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOD2P04179 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOD2P04179 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOD2P04179 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOD2P04179 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOD2P04179 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOD2P04179 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOD2P04179 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOD2P04179 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOD2P04179 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOD2P04179 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SOD2P04179 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOD2P04179 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SOD2P04179 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOD2P04179 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOD2P04179 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SOD2P04179 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOD2P04179 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOD2P04179 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOD2P04179 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOD2P04179 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOD2P04179 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOD2P04179 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOD2P04179 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOD2P04179 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOD2P04179 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOD2P04179 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOD2P04179 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOD2P04179 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOD2P04179 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOD2P04179 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOD2P04179 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOD2P04179 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SOD2P04179 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOD2P04179 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOD2P04179 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOD2P04179 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOD2P04179 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOD2P04179 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOD2P04179 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOD2P04179 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOD2P04179 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOD2P04179 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOD2P04179 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOD2P04179 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOD2P04179 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOD2P04179 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOD2P04179 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SOD2P04179 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOD2P04179 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOD2P04179 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOD2P04179 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOD2P04179 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOD2P04179 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOD2P04179 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOD2P04179 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOD2P04179 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOD2P04179 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOD2P04179 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOD2P04179 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOD2P04179 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SOD2P04179 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOD2P04179 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOD2P04179 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOD2P04179 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOD2P04179 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SOD2P04179 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SOD2P04179 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SOD2P04179 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SOD2P04179 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOD2P04179 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SOD2P04179 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOD2P04179 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOD2P04179 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms