Protein–RNA interactions for Protein: P03999

OPN1SW, Short-wave-sensitive opsin 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1SWP03999 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OPN1SWP03999 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms