Protein–RNA interactions for Protein: O96011

PEX11B, Peroxisomal membrane protein 11B, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11BO96011 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX11BO96011 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX11BO96011 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PEX11BO96011 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PEX11BO96011 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX11BO96011 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX11BO96011 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms