Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYF2O95926 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYF2O95926 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYF2O95926 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYF2O95926 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYF2O95926 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYF2O95926 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYF2O95926 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SYF2O95926 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYF2O95926 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYF2O95926 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYF2O95926 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYF2O95926 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYF2O95926 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYF2O95926 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYF2O95926 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYF2O95926 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYF2O95926 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYF2O95926 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SYF2O95926 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYF2O95926 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYF2O95926 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYF2O95926 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYF2O95926 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYF2O95926 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYF2O95926 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYF2O95926 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYF2O95926 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYF2O95926 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYF2O95926 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYF2O95926 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYF2O95926 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYF2O95926 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYF2O95926 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYF2O95926 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYF2O95926 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYF2O95926 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYF2O95926 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYF2O95926 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYF2O95926 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYF2O95926 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYF2O95926 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYF2O95926 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYF2O95926 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYF2O95926 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYF2O95926 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYF2O95926 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYF2O95926 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYF2O95926 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYF2O95926 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYF2O95926 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYF2O95926 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYF2O95926 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYF2O95926 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYF2O95926 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYF2O95926 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYF2O95926 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYF2O95926 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYF2O95926 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYF2O95926 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYF2O95926 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYF2O95926 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYF2O95926 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYF2O95926 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYF2O95926 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYF2O95926 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYF2O95926 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYF2O95926 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYF2O95926 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYF2O95926 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYF2O95926 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYF2O95926 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYF2O95926 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYF2O95926 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYF2O95926 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYF2O95926 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYF2O95926 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYF2O95926 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYF2O95926 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYF2O95926 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYF2O95926 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYF2O95926 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYF2O95926 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYF2O95926 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYF2O95926 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYF2O95926 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYF2O95926 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYF2O95926 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYF2O95926 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYF2O95926 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYF2O95926 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYF2O95926 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYF2O95926 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYF2O95926 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYF2O95926 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYF2O95926 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYF2O95926 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYF2O95926 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYF2O95926 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYF2O95926 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms