Protein–RNA interactions for Protein: O95859

TSPAN12, Tetraspanin-12, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN12O95859 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN12O95859 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSPAN12O95859 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms