Protein–RNA interactions for Protein: O95721

SNAP29, Synaptosomal-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP29O95721 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SNAP29O95721 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNAP29O95721 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNAP29O95721 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms