Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRAMEF12O95522 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF12O95522 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF12O95522 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF12O95522 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF12O95522 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF12O95522 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF12O95522 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF12O95522 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF12O95522 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF12O95522 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF12O95522 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF12O95522 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF12O95522 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF12O95522 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF12O95522 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF12O95522 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF12O95522 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF12O95522 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF12O95522 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF12O95522 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF12O95522 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF12O95522 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF12O95522 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF12O95522 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF12O95522 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF12O95522 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF12O95522 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF12O95522 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF12O95522 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF12O95522 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF12O95522 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF12O95522 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF12O95522 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms