Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX6O95503 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX6O95503 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX6O95503 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX6O95503 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX6O95503 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX6O95503 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX6O95503 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CBX6O95503 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CBX6O95503 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CBX6O95503 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CBX6O95503 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CBX6O95503 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CBX6O95503 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CBX6O95503 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CBX6O95503 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX6O95503 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX6O95503 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX6O95503 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX6O95503 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX6O95503 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX6O95503 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX6O95503 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX6O95503 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX6O95503 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX6O95503 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX6O95503 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBX6O95503 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX6O95503 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX6O95503 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX6O95503 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX6O95503 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX6O95503 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX6O95503 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBX6O95503 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX6O95503 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX6O95503 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX6O95503 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX6O95503 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX6O95503 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX6O95503 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CBX6O95503 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX6O95503 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX6O95503 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX6O95503 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX6O95503 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX6O95503 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX6O95503 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CBX6O95503 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBX6O95503 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBX6O95503 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CBX6O95503 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX6O95503 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX6O95503 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX6O95503 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX6O95503 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX6O95503 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX6O95503 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX6O95503 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX6O95503 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX6O95503 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CBX6O95503 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX6O95503 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX6O95503 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX6O95503 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX6O95503 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX6O95503 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX6O95503 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CBX6O95503 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX6O95503 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX6O95503 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX6O95503 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX6O95503 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX6O95503 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX6O95503 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX6O95503 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CBX6O95503 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX6O95503 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX6O95503 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX6O95503 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX6O95503 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX6O95503 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX6O95503 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX6O95503 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CBX6O95503 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX6O95503 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX6O95503 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX6O95503 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX6O95503 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX6O95503 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX6O95503 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX6O95503 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CBX6O95503 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CBX6O95503 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBX6O95503 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBX6O95503 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBX6O95503 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBX6O95503 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CBX6O95503 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX6O95503 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms