Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNGR4O95473 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SYNGR4O95473 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYNGR4O95473 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms