Protein–RNA interactions for Protein: O95455

TGDS, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGDSO95455 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGDSO95455 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGDSO95455 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGDSO95455 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGDSO95455 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGDSO95455 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGDSO95455 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGDSO95455 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGDSO95455 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGDSO95455 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGDSO95455 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGDSO95455 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGDSO95455 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGDSO95455 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGDSO95455 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGDSO95455 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGDSO95455 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGDSO95455 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGDSO95455 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGDSO95455 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGDSO95455 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGDSO95455 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGDSO95455 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TGDSO95455 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGDSO95455 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGDSO95455 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGDSO95455 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGDSO95455 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGDSO95455 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGDSO95455 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGDSO95455 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGDSO95455 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TGDSO95455 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGDSO95455 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGDSO95455 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGDSO95455 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TGDSO95455 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TGDSO95455 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TGDSO95455 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TGDSO95455 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TGDSO95455 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TGDSO95455 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGDSO95455 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGDSO95455 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGDSO95455 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGDSO95455 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGDSO95455 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGDSO95455 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TGDSO95455 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGDSO95455 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGDSO95455 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGDSO95455 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGDSO95455 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGDSO95455 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TGDSO95455 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGDSO95455 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGDSO95455 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TGDSO95455 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGDSO95455 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGDSO95455 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGDSO95455 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGDSO95455 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGDSO95455 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGDSO95455 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGDSO95455 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGDSO95455 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGDSO95455 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGDSO95455 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGDSO95455 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGDSO95455 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TGDSO95455 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TGDSO95455 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGDSO95455 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGDSO95455 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGDSO95455 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGDSO95455 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGDSO95455 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGDSO95455 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TGDSO95455 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGDSO95455 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGDSO95455 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGDSO95455 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TGDSO95455 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGDSO95455 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGDSO95455 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGDSO95455 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGDSO95455 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGDSO95455 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGDSO95455 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGDSO95455 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGDSO95455 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGDSO95455 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TGDSO95455 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGDSO95455 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGDSO95455 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGDSO95455 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGDSO95455 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGDSO95455 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGDSO95455 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGDSO95455 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.8 ms