Protein–RNA interactions for Protein: O95409

ZIC2, Zinc finger protein ZIC 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC2O95409 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZIC2O95409 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZIC2O95409 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms