Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MBD4O95243 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MBD4O95243 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MBD4O95243 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MBD4O95243 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MBD4O95243 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MBD4O95243 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MBD4O95243 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MBD4O95243 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MBD4O95243 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MBD4O95243 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MBD4O95243 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MBD4O95243 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MBD4O95243 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MBD4O95243 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MBD4O95243 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MBD4O95243 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MBD4O95243 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MBD4O95243 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MBD4O95243 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MBD4O95243 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MBD4O95243 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MBD4O95243 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MBD4O95243 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MBD4O95243 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MBD4O95243 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MBD4O95243 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MBD4O95243 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MBD4O95243 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MBD4O95243 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MBD4O95243 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MBD4O95243 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MBD4O95243 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MBD4O95243 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MBD4O95243 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MBD4O95243 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MBD4O95243 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MBD4O95243 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MBD4O95243 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MBD4O95243 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MBD4O95243 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MBD4O95243 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MBD4O95243 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MBD4O95243 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MBD4O95243 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MBD4O95243 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MBD4O95243 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MBD4O95243 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MBD4O95243 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
MBD4O95243 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MBD4O95243 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MBD4O95243 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MBD4O95243 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MBD4O95243 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MBD4O95243 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MBD4O95243 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MBD4O95243 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MBD4O95243 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MBD4O95243 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MBD4O95243 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MBD4O95243 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MBD4O95243 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MBD4O95243 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MBD4O95243 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MBD4O95243 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MBD4O95243 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MBD4O95243 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MBD4O95243 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MBD4O95243 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
MBD4O95243 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MBD4O95243 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MBD4O95243 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MBD4O95243 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MBD4O95243 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MBD4O95243 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MBD4O95243 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
MBD4O95243 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MBD4O95243 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MBD4O95243 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MBD4O95243 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
MBD4O95243 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MBD4O95243 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MBD4O95243 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MBD4O95243 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MBD4O95243 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MBD4O95243 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MBD4O95243 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MBD4O95243 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MBD4O95243 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MBD4O95243 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
MBD4O95243 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MBD4O95243 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MBD4O95243 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
MBD4O95243 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MBD4O95243 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MBD4O95243 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MBD4O95243 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
MBD4O95243 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
MBD4O95243 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MBD4O95243 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms