Protein–RNA interactions for Protein: O95197

RTN3, Reticulon-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN3O95197 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTN3O95197 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTN3O95197 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTN3O95197 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTN3O95197 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTN3O95197 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTN3O95197 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RTN3O95197 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RTN3O95197 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTN3O95197 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTN3O95197 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTN3O95197 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTN3O95197 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTN3O95197 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTN3O95197 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTN3O95197 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTN3O95197 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTN3O95197 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTN3O95197 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTN3O95197 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTN3O95197 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTN3O95197 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTN3O95197 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTN3O95197 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTN3O95197 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTN3O95197 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTN3O95197 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RTN3O95197 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RTN3O95197 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RTN3O95197 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTN3O95197 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTN3O95197 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTN3O95197 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTN3O95197 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTN3O95197 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTN3O95197 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTN3O95197 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTN3O95197 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTN3O95197 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTN3O95197 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTN3O95197 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTN3O95197 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTN3O95197 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTN3O95197 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTN3O95197 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTN3O95197 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTN3O95197 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTN3O95197 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTN3O95197 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RTN3O95197 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTN3O95197 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTN3O95197 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RTN3O95197 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTN3O95197 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTN3O95197 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTN3O95197 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTN3O95197 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTN3O95197 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RTN3O95197 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTN3O95197 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTN3O95197 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTN3O95197 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RTN3O95197 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTN3O95197 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTN3O95197 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTN3O95197 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTN3O95197 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RTN3O95197 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTN3O95197 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTN3O95197 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTN3O95197 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTN3O95197 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RTN3O95197 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RTN3O95197 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RTN3O95197 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTN3O95197 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTN3O95197 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTN3O95197 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTN3O95197 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RTN3O95197 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RTN3O95197 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTN3O95197 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTN3O95197 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTN3O95197 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTN3O95197 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RTN3O95197 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTN3O95197 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTN3O95197 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTN3O95197 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTN3O95197 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RTN3O95197 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RTN3O95197 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTN3O95197 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTN3O95197 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTN3O95197 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTN3O95197 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTN3O95197 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTN3O95197 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RTN3O95197 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RTN3O95197 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms