Protein–RNA interactions for Protein: O95150

TNFSF15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF15O95150 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFSF15O95150 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFSF15O95150 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms