Protein–RNA interactions for Protein: O94913

PCF11, Pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCF11O94913 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PCF11O94913 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PCF11O94913 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PCF11O94913 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PCF11O94913 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
PCF11O94913 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PCF11O94913 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PCF11O94913 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PCF11O94913 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PCF11O94913 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PCF11O94913 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PCF11O94913 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PCF11O94913 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PCF11O94913 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PCF11O94913 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PCF11O94913 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PCF11O94913 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PCF11O94913 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PCF11O94913 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PCF11O94913 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PCF11O94913 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PCF11O94913 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PCF11O94913 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
PCF11O94913 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PCF11O94913 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
PCF11O94913 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PCF11O94913 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PCF11O94913 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PCF11O94913 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PCF11O94913 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PCF11O94913 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PCF11O94913 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
PCF11O94913 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PCF11O94913 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PCF11O94913 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PCF11O94913 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PCF11O94913 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PCF11O94913 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PCF11O94913 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PCF11O94913 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PCF11O94913 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PCF11O94913 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PCF11O94913 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PCF11O94913 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PCF11O94913 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PCF11O94913 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PCF11O94913 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PCF11O94913 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
PCF11O94913 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PCF11O94913 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PCF11O94913 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PCF11O94913 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
PCF11O94913 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PCF11O94913 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PCF11O94913 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PCF11O94913 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PCF11O94913 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PCF11O94913 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
PCF11O94913 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PCF11O94913 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PCF11O94913 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PCF11O94913 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PCF11O94913 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PCF11O94913 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PCF11O94913 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PCF11O94913 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PCF11O94913 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PCF11O94913 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
PCF11O94913 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PCF11O94913 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PCF11O94913 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
PCF11O94913 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PCF11O94913 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PCF11O94913 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PCF11O94913 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PCF11O94913 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.45
PCF11O94913 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
PCF11O94913 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
PCF11O94913 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PCF11O94913 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PCF11O94913 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PCF11O94913 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PCF11O94913 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PCF11O94913 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PCF11O94913 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PCF11O94913 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PCF11O94913 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PCF11O94913 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PCF11O94913 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PCF11O94913 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PCF11O94913 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
PCF11O94913 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PCF11O94913 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PCF11O94913 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PCF11O94913 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PCF11O94913 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PCF11O94913 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PCF11O94913 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PCF11O94913 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PCF11O94913 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms