Protein–RNA interactions for Protein: O94907

DKK1, Dickkopf-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK1O94907 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DKK1O94907 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DKK1O94907 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DKK1O94907 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DKK1O94907 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DKK1O94907 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DKK1O94907 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DKK1O94907 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DKK1O94907 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DKK1O94907 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DKK1O94907 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DKK1O94907 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DKK1O94907 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DKK1O94907 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DKK1O94907 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DKK1O94907 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DKK1O94907 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DKK1O94907 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DKK1O94907 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DKK1O94907 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DKK1O94907 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DKK1O94907 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DKK1O94907 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DKK1O94907 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DKK1O94907 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DKK1O94907 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DKK1O94907 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DKK1O94907 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DKK1O94907 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DKK1O94907 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DKK1O94907 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DKK1O94907 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DKK1O94907 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DKK1O94907 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DKK1O94907 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DKK1O94907 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DKK1O94907 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DKK1O94907 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DKK1O94907 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DKK1O94907 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DKK1O94907 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DKK1O94907 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DKK1O94907 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DKK1O94907 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DKK1O94907 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DKK1O94907 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DKK1O94907 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DKK1O94907 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DKK1O94907 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DKK1O94907 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DKK1O94907 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DKK1O94907 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DKK1O94907 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DKK1O94907 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DKK1O94907 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DKK1O94907 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DKK1O94907 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DKK1O94907 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DKK1O94907 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DKK1O94907 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DKK1O94907 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DKK1O94907 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DKK1O94907 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DKK1O94907 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DKK1O94907 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DKK1O94907 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DKK1O94907 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DKK1O94907 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DKK1O94907 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DKK1O94907 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DKK1O94907 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DKK1O94907 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DKK1O94907 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DKK1O94907 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DKK1O94907 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DKK1O94907 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DKK1O94907 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DKK1O94907 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DKK1O94907 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DKK1O94907 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DKK1O94907 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DKK1O94907 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DKK1O94907 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DKK1O94907 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DKK1O94907 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DKK1O94907 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DKK1O94907 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DKK1O94907 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DKK1O94907 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DKK1O94907 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DKK1O94907 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DKK1O94907 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DKK1O94907 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DKK1O94907 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DKK1O94907 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DKK1O94907 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DKK1O94907 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DKK1O94907 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DKK1O94907 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DKK1O94907 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms