Protein–RNA interactions for Protein: O75531

BANF1, Barrier-to-autointegration factor, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BANF1O75531 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BANF1O75531 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BANF1O75531 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BANF1O75531 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BANF1O75531 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BANF1O75531 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BANF1O75531 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BANF1O75531 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BANF1O75531 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BANF1O75531 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BANF1O75531 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BANF1O75531 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BANF1O75531 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BANF1O75531 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BANF1O75531 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BANF1O75531 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BANF1O75531 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BANF1O75531 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BANF1O75531 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BANF1O75531 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BANF1O75531 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BANF1O75531 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BANF1O75531 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BANF1O75531 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BANF1O75531 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BANF1O75531 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BANF1O75531 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BANF1O75531 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BANF1O75531 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BANF1O75531 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BANF1O75531 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BANF1O75531 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BANF1O75531 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BANF1O75531 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BANF1O75531 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BANF1O75531 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BANF1O75531 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BANF1O75531 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BANF1O75531 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BANF1O75531 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BANF1O75531 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BANF1O75531 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BANF1O75531 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BANF1O75531 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BANF1O75531 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BANF1O75531 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BANF1O75531 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BANF1O75531 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BANF1O75531 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BANF1O75531 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BANF1O75531 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BANF1O75531 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BANF1O75531 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BANF1O75531 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BANF1O75531 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BANF1O75531 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BANF1O75531 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BANF1O75531 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BANF1O75531 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BANF1O75531 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BANF1O75531 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BANF1O75531 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BANF1O75531 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BANF1O75531 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BANF1O75531 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BANF1O75531 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BANF1O75531 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BANF1O75531 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BANF1O75531 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BANF1O75531 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BANF1O75531 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BANF1O75531 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BANF1O75531 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BANF1O75531 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BANF1O75531 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BANF1O75531 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BANF1O75531 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BANF1O75531 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BANF1O75531 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BANF1O75531 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BANF1O75531 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BANF1O75531 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BANF1O75531 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BANF1O75531 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BANF1O75531 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BANF1O75531 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BANF1O75531 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BANF1O75531 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BANF1O75531 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BANF1O75531 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BANF1O75531 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BANF1O75531 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BANF1O75531 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BANF1O75531 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BANF1O75531 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BANF1O75531 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BANF1O75531 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BANF1O75531 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BANF1O75531 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BANF1O75531 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms