Protein–RNA interactions for Protein: O75436

VPS26A, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS26AO75436 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VPS26AO75436 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS26AO75436 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS26AO75436 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms