Protein–RNA interactions for Protein: O75132

ZBED4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED4O75132 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZBED4O75132 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
ZBED4O75132 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZBED4O75132 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZBED4O75132 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZBED4O75132 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZBED4O75132 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZBED4O75132 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZBED4O75132 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZBED4O75132 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED4O75132 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED4O75132 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED4O75132 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED4O75132 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED4O75132 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED4O75132 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED4O75132 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED4O75132 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZBED4O75132 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED4O75132 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED4O75132 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED4O75132 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZBED4O75132 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED4O75132 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED4O75132 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED4O75132 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED4O75132 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED4O75132 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED4O75132 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED4O75132 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED4O75132 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZBED4O75132 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED4O75132 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED4O75132 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED4O75132 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED4O75132 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZBED4O75132 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED4O75132 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZBED4O75132 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZBED4O75132 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZBED4O75132 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZBED4O75132 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZBED4O75132 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZBED4O75132 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZBED4O75132 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ZBED4O75132 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED4O75132 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED4O75132 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED4O75132 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms