Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR5O60602 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR5O60602 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TLR5O60602 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TLR5O60602 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TLR5O60602 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TLR5O60602 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TLR5O60602 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TLR5O60602 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TLR5O60602 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR5O60602 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR5O60602 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR5O60602 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR5O60602 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR5O60602 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR5O60602 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR5O60602 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TLR5O60602 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR5O60602 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR5O60602 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR5O60602 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR5O60602 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR5O60602 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR5O60602 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR5O60602 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR5O60602 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR5O60602 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TLR5O60602 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR5O60602 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR5O60602 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR5O60602 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR5O60602 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR5O60602 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR5O60602 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR5O60602 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR5O60602 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR5O60602 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR5O60602 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR5O60602 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR5O60602 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TLR5O60602 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLR5O60602 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLR5O60602 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLR5O60602 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TLR5O60602 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLR5O60602 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLR5O60602 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLR5O60602 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLR5O60602 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLR5O60602 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLR5O60602 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLR5O60602 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TLR5O60602 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR5O60602 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR5O60602 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR5O60602 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR5O60602 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR5O60602 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR5O60602 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TLR5O60602 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR5O60602 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR5O60602 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR5O60602 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR5O60602 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR5O60602 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR5O60602 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR5O60602 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR5O60602 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR5O60602 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR5O60602 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR5O60602 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TLR5O60602 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TLR5O60602 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TLR5O60602 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TLR5O60602 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TLR5O60602 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TLR5O60602 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TLR5O60602 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TLR5O60602 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TLR5O60602 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TLR5O60602 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TLR5O60602 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR5O60602 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR5O60602 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR5O60602 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR5O60602 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR5O60602 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR5O60602 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR5O60602 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR5O60602 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR5O60602 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR5O60602 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TLR5O60602 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLR5O60602 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLR5O60602 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLR5O60602 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLR5O60602 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TLR5O60602 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TLR5O60602 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TLR5O60602 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms