Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PLIN1O60240 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PLIN1O60240 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PLIN1O60240 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PLIN1O60240 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PLIN1O60240 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PLIN1O60240 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PLIN1O60240 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PLIN1O60240 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PLIN1O60240 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PLIN1O60240 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PLIN1O60240 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PLIN1O60240 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PLIN1O60240 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PLIN1O60240 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PLIN1O60240 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PLIN1O60240 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PLIN1O60240 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
PLIN1O60240 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PLIN1O60240 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PLIN1O60240 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms