Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CREB3O43889 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CREB3O43889 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CREB3O43889 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CREB3O43889 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CREB3O43889 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CREB3O43889 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CREB3O43889 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CREB3O43889 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CREB3O43889 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CREB3O43889 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CREB3O43889 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CREB3O43889 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CREB3O43889 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CREB3O43889 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CREB3O43889 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CREB3O43889 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CREB3O43889 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CREB3O43889 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CREB3O43889 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CREB3O43889 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CREB3O43889 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CREB3O43889 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CREB3O43889 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CREB3O43889 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CREB3O43889 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CREB3O43889 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CREB3O43889 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CREB3O43889 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CREB3O43889 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CREB3O43889 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CREB3O43889 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CREB3O43889 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CREB3O43889 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CREB3O43889 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CREB3O43889 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CREB3O43889 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CREB3O43889 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB3O43889 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB3O43889 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB3O43889 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB3O43889 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB3O43889 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB3O43889 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB3O43889 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB3O43889 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB3O43889 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB3O43889 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB3O43889 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB3O43889 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB3O43889 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB3O43889 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CREB3O43889 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CREB3O43889 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CREB3O43889 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CREB3O43889 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CREB3O43889 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CREB3O43889 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CREB3O43889 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CREB3O43889 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CREB3O43889 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CREB3O43889 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CREB3O43889 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CREB3O43889 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CREB3O43889 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CREB3O43889 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CREB3O43889 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CREB3O43889 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CREB3O43889 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CREB3O43889 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CREB3O43889 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CREB3O43889 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CREB3O43889 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CREB3O43889 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CREB3O43889 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CREB3O43889 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CREB3O43889 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CREB3O43889 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CREB3O43889 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CREB3O43889 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CREB3O43889 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CREB3O43889 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CREB3O43889 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CREB3O43889 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CREB3O43889 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CREB3O43889 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CREB3O43889 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CREB3O43889 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CREB3O43889 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CREB3O43889 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CREB3O43889 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CREB3O43889 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CREB3O43889 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CREB3O43889 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CREB3O43889 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CREB3O43889 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CREB3O43889 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CREB3O43889 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CREB3O43889 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CREB3O43889 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms