Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC25A20O43772 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC25A20O43772 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms