Protein–RNA interactions for Protein: O43493

TGOLN2, Trans-Golgi network integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGOLN2O43493 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TGOLN2O43493 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms