Protein–RNA interactions for Protein: O43474

KLF4, Krueppel-like factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF4O43474 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF4O43474 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF4O43474 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF4O43474 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF4O43474 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF4O43474 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF4O43474 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF4O43474 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF4O43474 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF4O43474 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF4O43474 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF4O43474 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF4O43474 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF4O43474 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF4O43474 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF4O43474 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF4O43474 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF4O43474 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF4O43474 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF4O43474 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF4O43474 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLF4O43474 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
KLF4O43474 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF4O43474 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF4O43474 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF4O43474 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF4O43474 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF4O43474 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF4O43474 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF4O43474 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF4O43474 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLF4O43474 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF4O43474 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF4O43474 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF4O43474 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF4O43474 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF4O43474 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF4O43474 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLF4O43474 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF4O43474 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF4O43474 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF4O43474 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF4O43474 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF4O43474 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF4O43474 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF4O43474 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLF4O43474 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF4O43474 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF4O43474 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF4O43474 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF4O43474 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF4O43474 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF4O43474 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF4O43474 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF4O43474 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF4O43474 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF4O43474 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF4O43474 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF4O43474 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF4O43474 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLF4O43474 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF4O43474 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF4O43474 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF4O43474 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF4O43474 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF4O43474 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF4O43474 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF4O43474 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLF4O43474 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF4O43474 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF4O43474 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF4O43474 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF4O43474 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF4O43474 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLF4O43474 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLF4O43474 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLF4O43474 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLF4O43474 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLF4O43474 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLF4O43474 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLF4O43474 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KLF4O43474 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLF4O43474 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLF4O43474 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF4O43474 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF4O43474 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF4O43474 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF4O43474 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF4O43474 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF4O43474 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF4O43474 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF4O43474 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF4O43474 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF4O43474 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF4O43474 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF4O43474 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF4O43474 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF4O43474 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF4O43474 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF4O43474 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms