Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA2O43364 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA2O43364 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA2O43364 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms