Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSI1O43347 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSI1O43347 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSI1O43347 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSI1O43347 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSI1O43347 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSI1O43347 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MSI1O43347 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MSI1O43347 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MSI1O43347 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSI1O43347 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSI1O43347 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSI1O43347 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSI1O43347 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSI1O43347 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSI1O43347 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSI1O43347 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSI1O43347 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSI1O43347 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSI1O43347 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSI1O43347 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSI1O43347 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSI1O43347 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSI1O43347 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSI1O43347 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSI1O43347 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSI1O43347 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSI1O43347 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSI1O43347 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSI1O43347 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSI1O43347 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MSI1O43347 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSI1O43347 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSI1O43347 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MSI1O43347 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MSI1O43347 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSI1O43347 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSI1O43347 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSI1O43347 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSI1O43347 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSI1O43347 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSI1O43347 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSI1O43347 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSI1O43347 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSI1O43347 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSI1O43347 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSI1O43347 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSI1O43347 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSI1O43347 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MSI1O43347 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSI1O43347 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSI1O43347 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSI1O43347 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSI1O43347 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSI1O43347 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSI1O43347 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSI1O43347 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSI1O43347 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSI1O43347 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MSI1O43347 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSI1O43347 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSI1O43347 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSI1O43347 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSI1O43347 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSI1O43347 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSI1O43347 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSI1O43347 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSI1O43347 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSI1O43347 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSI1O43347 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MSI1O43347 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSI1O43347 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSI1O43347 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSI1O43347 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSI1O43347 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSI1O43347 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSI1O43347 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSI1O43347 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSI1O43347 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MSI1O43347 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSI1O43347 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSI1O43347 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSI1O43347 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSI1O43347 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSI1O43347 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSI1O43347 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSI1O43347 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSI1O43347 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSI1O43347 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSI1O43347 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSI1O43347 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSI1O43347 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSI1O43347 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSI1O43347 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSI1O43347 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSI1O43347 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSI1O43347 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSI1O43347 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSI1O43347 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MSI1O43347 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms