Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRXO43186 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRXO43186 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRXO43186 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRXO43186 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRXO43186 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRXO43186 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRXO43186 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRXO43186 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CRXO43186 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRXO43186 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRXO43186 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRXO43186 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CRXO43186 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CRXO43186 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CRXO43186 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CRXO43186 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CRXO43186 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRXO43186 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRXO43186 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRXO43186 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRXO43186 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRXO43186 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRXO43186 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRXO43186 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRXO43186 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRXO43186 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRXO43186 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRXO43186 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRXO43186 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRXO43186 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CRXO43186 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRXO43186 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRXO43186 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRXO43186 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRXO43186 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRXO43186 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRXO43186 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRXO43186 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRXO43186 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRXO43186 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRXO43186 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRXO43186 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRXO43186 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRXO43186 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRXO43186 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRXO43186 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRXO43186 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRXO43186 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRXO43186 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRXO43186 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRXO43186 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CRXO43186 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRXO43186 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CRXO43186 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRXO43186 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRXO43186 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRXO43186 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRXO43186 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CRXO43186 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRXO43186 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRXO43186 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRXO43186 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRXO43186 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRXO43186 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRXO43186 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRXO43186 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRXO43186 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRXO43186 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRXO43186 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRXO43186 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRXO43186 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRXO43186 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRXO43186 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRXO43186 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRXO43186 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRXO43186 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRXO43186 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CRXO43186 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRXO43186 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CRXO43186 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CRXO43186 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CRXO43186 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CRXO43186 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CRXO43186 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CRXO43186 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRXO43186 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRXO43186 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRXO43186 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRXO43186 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRXO43186 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRXO43186 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRXO43186 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRXO43186 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRXO43186 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRXO43186 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRXO43186 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRXO43186 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRXO43186 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRXO43186 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms