Protein–RNA interactions for Protein: O43159

RRP8, Ribosomal RNA-processing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP8O43159 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP8O43159 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP8O43159 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP8O43159 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP8O43159 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRP8O43159 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRP8O43159 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRP8O43159 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRP8O43159 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRP8O43159 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP8O43159 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP8O43159 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP8O43159 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP8O43159 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP8O43159 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP8O43159 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP8O43159 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RRP8O43159 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RRP8O43159 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RRP8O43159 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RRP8O43159 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RRP8O43159 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RRP8O43159 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RRP8O43159 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RRP8O43159 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RRP8O43159 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RRP8O43159 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RRP8O43159 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RRP8O43159 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RRP8O43159 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RRP8O43159 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RRP8O43159 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RRP8O43159 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RRP8O43159 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RRP8O43159 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRP8O43159 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRP8O43159 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRP8O43159 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRP8O43159 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RRP8O43159 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RRP8O43159 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
RRP8O43159 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RRP8O43159 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RRP8O43159 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RRP8O43159 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RRP8O43159 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RRP8O43159 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RRP8O43159 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RRP8O43159 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRP8O43159 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRP8O43159 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRP8O43159 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRP8O43159 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRP8O43159 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRP8O43159 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRP8O43159 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRP8O43159 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRP8O43159 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRP8O43159 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRP8O43159 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRP8O43159 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRP8O43159 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRP8O43159 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRP8O43159 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRP8O43159 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRP8O43159 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRP8O43159 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRP8O43159 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRP8O43159 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRP8O43159 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RRP8O43159 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRP8O43159 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRP8O43159 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRP8O43159 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP8O43159 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP8O43159 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP8O43159 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP8O43159 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP8O43159 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP8O43159 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP8O43159 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP8O43159 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP8O43159 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP8O43159 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP8O43159 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP8O43159 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP8O43159 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP8O43159 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP8O43159 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP8O43159 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRP8O43159 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRP8O43159 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RRP8O43159 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRP8O43159 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRP8O43159 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRP8O43159 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRP8O43159 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRP8O43159 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RRP8O43159 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RRP8O43159 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
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