Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEFVO15553 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEFVO15553 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEFVO15553 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEFVO15553 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEFVO15553 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEFVO15553 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEFVO15553 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEFVO15553 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEFVO15553 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEFVO15553 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEFVO15553 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MEFVO15553 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MEFVO15553 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MEFVO15553 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MEFVO15553 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MEFVO15553 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MEFVO15553 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEFVO15553 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEFVO15553 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEFVO15553 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEFVO15553 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEFVO15553 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEFVO15553 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEFVO15553 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEFVO15553 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MEFVO15553 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEFVO15553 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MEFVO15553 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MEFVO15553 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MEFVO15553 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MEFVO15553 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MEFVO15553 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MEFVO15553 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MEFVO15553 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MEFVO15553 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MEFVO15553 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MEFVO15553 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MEFVO15553 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MEFVO15553 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MEFVO15553 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MEFVO15553 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MEFVO15553 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MEFVO15553 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MEFVO15553 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MEFVO15553 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MEFVO15553 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MEFVO15553 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MEFVO15553 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MEFVO15553 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MEFVO15553 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MEFVO15553 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MEFVO15553 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MEFVO15553 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MEFVO15553 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MEFVO15553 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MEFVO15553 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MEFVO15553 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MEFVO15553 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MEFVO15553 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MEFVO15553 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MEFVO15553 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MEFVO15553 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEFVO15553 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEFVO15553 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEFVO15553 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEFVO15553 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEFVO15553 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEFVO15553 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEFVO15553 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEFVO15553 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEFVO15553 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEFVO15553 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MEFVO15553 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEFVO15553 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEFVO15553 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEFVO15553 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEFVO15553 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEFVO15553 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEFVO15553 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MEFVO15553 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEFVO15553 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEFVO15553 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEFVO15553 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEFVO15553 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEFVO15553 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MEFVO15553 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEFVO15553 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEFVO15553 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEFVO15553 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEFVO15553 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MEFVO15553 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEFVO15553 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEFVO15553 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MEFVO15553 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MEFVO15553 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MEFVO15553 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MEFVO15553 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MEFVO15553 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MEFVO15553 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms