Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
VGFO15240 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
VGFO15240 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
VGFO15240 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
VGFO15240 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
VGFO15240 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
VGFO15240 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
VGFO15240 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
VGFO15240 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
VGFO15240 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
VGFO15240 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
VGFO15240 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
VGFO15240 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
VGFO15240 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
VGFO15240 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
VGFO15240 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
VGFO15240 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
VGFO15240 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
VGFO15240 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
VGFO15240 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
VGFO15240 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
VGFO15240 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC33.26■■■□□ 2.91
VGFO15240 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
VGFO15240 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
VGFO15240 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
VGFO15240 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
VGFO15240 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
VGFO15240 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
VGFO15240 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
VGFO15240 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
VGFO15240 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
VGFO15240 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
VGFO15240 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
VGFO15240 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
VGFO15240 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.23■■■□□ 2.91
VGFO15240 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
VGFO15240 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
VGFO15240 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
VGFO15240 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
VGFO15240 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
VGFO15240 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
VGFO15240 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
VGFO15240 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
VGFO15240 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
VGFO15240 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
VGFO15240 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
VGFO15240 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
VGFO15240 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
VGFO15240 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
VGFO15240 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
VGFO15240 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
VGFO15240 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
VGFO15240 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
VGFO15240 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
VGFO15240 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
VGFO15240 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
VGFO15240 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
VGFO15240 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
VGFO15240 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
VGFO15240 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
VGFO15240 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
VGFO15240 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
VGFO15240 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
VGFO15240 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
VGFO15240 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
VGFO15240 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
VGFO15240 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
VGFO15240 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
VGFO15240 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
VGFO15240 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
VGFO15240 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
VGFO15240 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
VGFO15240 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
VGFO15240 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
VGFO15240 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
VGFO15240 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
VGFO15240 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
VGFO15240 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
VGFO15240 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
VGFO15240 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
VGFO15240 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
VGFO15240 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
VGFO15240 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
VGFO15240 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
VGFO15240 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
VGFO15240 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
VGFO15240 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
VGFO15240 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
VGFO15240 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
VGFO15240 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
VGFO15240 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
VGFO15240 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
VGFO15240 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
VGFO15240 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
VGFO15240 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
VGFO15240 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
VGFO15240 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
VGFO15240 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
VGFO15240 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
VGFO15240 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms