Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNPHO15079 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNPHO15079 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNPHO15079 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNPHO15079 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNPHO15079 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SNPHO15079 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNPHO15079 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNPHO15079 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNPHO15079 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNPHO15079 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNPHO15079 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNPHO15079 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SNPHO15079 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SNPHO15079 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNPHO15079 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNPHO15079 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNPHO15079 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNPHO15079 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNPHO15079 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNPHO15079 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNPHO15079 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNPHO15079 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNPHO15079 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNPHO15079 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNPHO15079 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNPHO15079 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNPHO15079 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNPHO15079 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNPHO15079 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNPHO15079 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNPHO15079 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNPHO15079 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNPHO15079 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNPHO15079 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNPHO15079 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNPHO15079 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNPHO15079 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNPHO15079 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNPHO15079 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNPHO15079 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNPHO15079 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNPHO15079 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNPHO15079 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNPHO15079 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNPHO15079 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNPHO15079 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNPHO15079 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNPHO15079 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SNPHO15079 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNPHO15079 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNPHO15079 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNPHO15079 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNPHO15079 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SNPHO15079 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNPHO15079 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNPHO15079 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNPHO15079 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNPHO15079 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNPHO15079 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNPHO15079 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNPHO15079 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNPHO15079 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNPHO15079 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNPHO15079 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNPHO15079 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNPHO15079 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNPHO15079 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNPHO15079 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNPHO15079 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNPHO15079 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNPHO15079 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNPHO15079 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNPHO15079 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNPHO15079 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNPHO15079 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNPHO15079 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNPHO15079 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNPHO15079 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNPHO15079 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNPHO15079 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNPHO15079 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNPHO15079 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNPHO15079 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNPHO15079 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNPHO15079 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNPHO15079 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNPHO15079 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNPHO15079 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SNPHO15079 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNPHO15079 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNPHO15079 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNPHO15079 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNPHO15079 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNPHO15079 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNPHO15079 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNPHO15079 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNPHO15079 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNPHO15079 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNPHO15079 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms