Protein–RNA interactions for Protein: O15034

RIMBP2, RIMS-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP2O15034 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RIMBP2O15034 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RIMBP2O15034 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RIMBP2O15034 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RIMBP2O15034 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RIMBP2O15034 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RIMBP2O15034 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RIMBP2O15034 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RIMBP2O15034 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RIMBP2O15034 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIMBP2O15034 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIMBP2O15034 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIMBP2O15034 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIMBP2O15034 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIMBP2O15034 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIMBP2O15034 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIMBP2O15034 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIMBP2O15034 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIMBP2O15034 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIMBP2O15034 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIMBP2O15034 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIMBP2O15034 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIMBP2O15034 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIMBP2O15034 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIMBP2O15034 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIMBP2O15034 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIMBP2O15034 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RIMBP2O15034 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RIMBP2O15034 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RIMBP2O15034 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RIMBP2O15034 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RIMBP2O15034 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RIMBP2O15034 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RIMBP2O15034 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RIMBP2O15034 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RIMBP2O15034 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RIMBP2O15034 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RIMBP2O15034 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RIMBP2O15034 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RIMBP2O15034 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RIMBP2O15034 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RIMBP2O15034 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RIMBP2O15034 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RIMBP2O15034 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RIMBP2O15034 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RIMBP2O15034 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RIMBP2O15034 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RIMBP2O15034 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RIMBP2O15034 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RIMBP2O15034 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RIMBP2O15034 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RIMBP2O15034 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RIMBP2O15034 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RIMBP2O15034 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RIMBP2O15034 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RIMBP2O15034 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RIMBP2O15034 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RIMBP2O15034 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RIMBP2O15034 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms