Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BCKDKO14874 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BCKDKO14874 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BCKDKO14874 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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