Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KPNA3O00505 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KPNA3O00505 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KPNA3O00505 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms