Protein–RNA interactions for Protein: O00268

TAF4, Transcription initiation factor TFIID subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4O00268 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TAF4O00268 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF4O00268 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF4O00268 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF4O00268 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF4O00268 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TAF4O00268 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF4O00268 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF4O00268 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF4O00268 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF4O00268 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF4O00268 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF4O00268 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TAF4O00268 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF4O00268 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF4O00268 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF4O00268 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF4O00268 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF4O00268 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF4O00268 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF4O00268 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF4O00268 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF4O00268 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF4O00268 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF4O00268 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF4O00268 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF4O00268 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF4O00268 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF4O00268 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF4O00268 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF4O00268 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF4O00268 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF4O00268 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF4O00268 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF4O00268 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF4O00268 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF4O00268 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF4O00268 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF4O00268 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF4O00268 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF4O00268 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF4O00268 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF4O00268 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF4O00268 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF4O00268 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF4O00268 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF4O00268 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF4O00268 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF4O00268 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF4O00268 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF4O00268 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF4O00268 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF4O00268 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF4O00268 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF4O00268 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF4O00268 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF4O00268 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF4O00268 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF4O00268 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF4O00268 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF4O00268 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF4O00268 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF4O00268 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF4O00268 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF4O00268 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF4O00268 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF4O00268 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF4O00268 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF4O00268 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF4O00268 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF4O00268 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF4O00268 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF4O00268 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF4O00268 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF4O00268 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF4O00268 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF4O00268 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF4O00268 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF4O00268 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF4O00268 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF4O00268 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF4O00268 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TAF4O00268 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF4O00268 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF4O00268 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF4O00268 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF4O00268 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF4O00268 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF4O00268 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF4O00268 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TAF4O00268 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TAF4O00268 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF4O00268 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF4O00268 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF4O00268 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF4O00268 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF4O00268 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF4O00268 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF4O00268 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF4O00268 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms