Protein–RNA interactions for Protein: O00264

PGRMC1, Membrane-associated progesterone receptor component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRMC1O00264 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGRMC1O00264 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PGRMC1O00264 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGRMC1O00264 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms