Protein–RNA interactions for Protein: O00160

MYO1F, Unconventional myosin-If, humanhuman

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1FO00160 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYO1FO00160 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYO1FO00160 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MYO1FO00160 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYO1FO00160 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYO1FO00160 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYO1FO00160 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYO1FO00160 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYO1FO00160 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYO1FO00160 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MYO1FO00160 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYO1FO00160 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYO1FO00160 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYO1FO00160 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYO1FO00160 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYO1FO00160 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYO1FO00160 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYO1FO00160 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MYO1FO00160 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MYO1FO00160 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYO1FO00160 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO1FO00160 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO1FO00160 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO1FO00160 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO1FO00160 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO1FO00160 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO1FO00160 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO1FO00160 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO1FO00160 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO1FO00160 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO1FO00160 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO1FO00160 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO1FO00160 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO1FO00160 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO1FO00160 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO1FO00160 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO1FO00160 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO1FO00160 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO1FO00160 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO1FO00160 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO1FO00160 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO1FO00160 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO1FO00160 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO1FO00160 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO1FO00160 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO1FO00160 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO1FO00160 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO1FO00160 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO1FO00160 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO1FO00160 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO1FO00160 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO1FO00160 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO1FO00160 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO1FO00160 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO1FO00160 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO1FO00160 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO1FO00160 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO1FO00160 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms