Protein–RNA interactions for Protein: J3KTA2

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KTA2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3KTA2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3KTA2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3KTA2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3KTA2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3KTA2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3KTA2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3KTA2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3KTA2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3KTA2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3KTA2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3KTA2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3KTA2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3KTA2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
J3KTA2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
J3KTA2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
J3KTA2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
J3KTA2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3KTA2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3KTA2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3KTA2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3KTA2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3KTA2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3KTA2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3KTA2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3KTA2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3KTA2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3KTA2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3KTA2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3KTA2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
J3KTA2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3KTA2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3KTA2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3KTA2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
J3KTA2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
J3KTA2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3KTA2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3KTA2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3KTA2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3KTA2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3KTA2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
J3KTA2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
J3KTA2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3KTA2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3KTA2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3KTA2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3KTA2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
J3KTA2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3KTA2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3KTA2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3KTA2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3KTA2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3KTA2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3KTA2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3KTA2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
J3KTA2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3KTA2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3KTA2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3KTA2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3KTA2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3KTA2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3KTA2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
J3KTA2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
J3KTA2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3KTA2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3KTA2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3KTA2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3KTA2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3KTA2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3KTA2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3KTA2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
J3KTA2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3KTA2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3KTA2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
J3KTA2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3KTA2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3KTA2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3KTA2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3KTA2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3KTA2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3KTA2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3KTA2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
J3KTA2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
J3KTA2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
J3KTA2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
J3KTA2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
J3KTA2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3KTA2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3KTA2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3KTA2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3KTA2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3KTA2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
J3KTA2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.32■■□□□ 1
J3KTA2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3KTA2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3KTA2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3KTA2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
J3KTA2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
J3KTA2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
J3KTA2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms