Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
H7C1D1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
H7C1D1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
H7C1D1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
H7C1D1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
H7C1D1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
H7C1D1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
H7C1D1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
H7C1D1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
H7C1D1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
H7C1D1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
H7C1D1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
H7C1D1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
H7C1D1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
H7C1D1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
H7C1D1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
H7C1D1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
H7C1D1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
H7C1D1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
H7C1D1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
H7C1D1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
H7C1D1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
H7C1D1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
H7C1D1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
H7C1D1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
H7C1D1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
H7C1D1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
H7C1D1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
H7C1D1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
H7C1D1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
H7C1D1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
H7C1D1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
H7C1D1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
H7C1D1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
H7C1D1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
H7C1D1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
H7C1D1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
H7C1D1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
H7C1D1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
H7C1D1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
H7C1D1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
H7C1D1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
H7C1D1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
H7C1D1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
H7C1D1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
H7C1D1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
H7C1D1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
H7C1D1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
H7C1D1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
H7C1D1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
H7C1D1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
H7C1D1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
H7C1D1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
H7C1D1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
H7C1D1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
H7C1D1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
H7C1D1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
H7C1D1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
H7C1D1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
H7C1D1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
H7C1D1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
H7C1D1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
H7C1D1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
H7C1D1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
H7C1D1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
H7C1D1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
H7C1D1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
H7C1D1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
H7C1D1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
H7C1D1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
H7C1D1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
H7C1D1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
H7C1D1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
H7C1D1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
H7C1D1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
H7C1D1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
H7C1D1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
H7C1D1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
H7C1D1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
H7C1D1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
H7C1D1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
H7C1D1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
H7C1D1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
H7C1D1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
H7C1D1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
H7C1D1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
H7C1D1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
H7C1D1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
H7C1D1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
H7C1D1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
H7C1D1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
H7C1D1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
H7C1D1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
H7C1D1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
H7C1D1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
H7C1D1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
H7C1D1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
H7C1D1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
H7C1D1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
H7C1D1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms