Protein–RNA interactions for Protein: H3BSA7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BSA7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H3BSA7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H3BSA7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H3BSA7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H3BSA7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H3BSA7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H3BSA7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H3BSA7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H3BSA7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H3BSA7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H3BSA7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
H3BSA7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
H3BSA7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3BSA7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3BSA7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3BSA7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3BSA7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3BSA7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3BSA7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3BSA7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3BSA7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3BSA7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3BSA7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3BSA7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3BSA7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3BSA7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3BSA7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3BSA7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3BSA7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3BSA7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3BSA7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3BSA7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3BSA7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3BSA7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3BSA7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3BSA7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3BSA7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3BSA7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3BSA7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3BSA7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3BSA7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3BSA7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3BSA7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3BSA7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3BSA7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3BSA7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3BSA7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3BSA7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
H3BSA7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BSA7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BSA7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BSA7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BSA7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BSA7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BSA7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BSA7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BSA7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BSA7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BSA7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BSA7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BSA7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
H3BSA7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3BSA7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3BSA7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
H3BSA7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3BSA7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3BSA7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
H3BSA7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3BSA7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3BSA7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
H3BSA7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3BSA7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3BSA7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
H3BSA7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3BSA7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3BSA7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3BSA7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3BSA7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3BSA7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3BSA7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3BSA7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3BSA7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BSA7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BSA7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BSA7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BSA7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BSA7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BSA7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BSA7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3BSA7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BSA7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BSA7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BSA7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BSA7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3BSA7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BSA7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BSA7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BSA7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BSA7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3BSA7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms