Protein–RNA interactions for Protein: F8W031

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8W031 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
F8W031 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
F8W031 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
F8W031 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
F8W031 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
F8W031 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
F8W031 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
F8W031 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
F8W031 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
F8W031 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
F8W031 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
F8W031 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
F8W031 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
F8W031 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
F8W031 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
F8W031 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
F8W031 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
F8W031 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
F8W031 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
F8W031 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
F8W031 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
F8W031 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
F8W031 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
F8W031 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
F8W031 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
F8W031 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
F8W031 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
F8W031 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
F8W031 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
F8W031 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
F8W031 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
F8W031 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
F8W031 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
F8W031 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
F8W031 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
F8W031 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
F8W031 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
F8W031 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
F8W031 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
F8W031 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
F8W031 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
F8W031 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
F8W031 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
F8W031 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
F8W031 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
F8W031 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
F8W031 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
F8W031 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
F8W031 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
F8W031 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
F8W031 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
F8W031 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
F8W031 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
F8W031 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
F8W031 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
F8W031 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
F8W031 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
F8W031 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
F8W031 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
F8W031 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
F8W031 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
F8W031 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
F8W031 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
F8W031 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
F8W031 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
F8W031 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
F8W031 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
F8W031 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
F8W031 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
F8W031 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
F8W031 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
F8W031 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
F8W031 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
F8W031 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
F8W031 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
F8W031 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
F8W031 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
F8W031 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
F8W031 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
F8W031 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
F8W031 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
F8W031 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
F8W031 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
F8W031 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
F8W031 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
F8W031 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
F8W031 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
F8W031 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
F8W031 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
F8W031 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
F8W031 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
F8W031 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
F8W031 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
F8W031 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
F8W031 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
F8W031 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
F8W031 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
F8W031 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
F8W031 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
F8W031 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms