Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NEDD8-MDP1E9PL57 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms