Protein–RNA interactions for Protein: E9PJ23

NPIPB6, Nuclear pore complex-interacting protein family member B6, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB6E9PJ23 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NPIPB6E9PJ23 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms