Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERVV-1B6SEH8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERVV-1B6SEH8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERVV-1B6SEH8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERVV-1B6SEH8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ERVV-1B6SEH8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ERVV-1B6SEH8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ERVV-1B6SEH8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ERVV-1B6SEH8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ERVV-1B6SEH8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ERVV-1B6SEH8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ERVV-1B6SEH8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ERVV-1B6SEH8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ERVV-1B6SEH8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ERVV-1B6SEH8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ERVV-1B6SEH8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERVV-1B6SEH8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERVV-1B6SEH8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERVV-1B6SEH8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERVV-1B6SEH8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERVV-1B6SEH8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERVV-1B6SEH8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERVV-1B6SEH8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERVV-1B6SEH8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERVV-1B6SEH8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERVV-1B6SEH8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERVV-1B6SEH8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERVV-1B6SEH8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERVV-1B6SEH8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERVV-1B6SEH8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERVV-1B6SEH8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ERVV-1B6SEH8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ERVV-1B6SEH8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERVV-1B6SEH8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERVV-1B6SEH8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERVV-1B6SEH8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ERVV-1B6SEH8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERVV-1B6SEH8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERVV-1B6SEH8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERVV-1B6SEH8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERVV-1B6SEH8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ERVV-1B6SEH8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERVV-1B6SEH8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERVV-1B6SEH8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERVV-1B6SEH8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERVV-1B6SEH8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERVV-1B6SEH8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERVV-1B6SEH8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERVV-1B6SEH8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERVV-1B6SEH8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERVV-1B6SEH8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERVV-1B6SEH8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ERVV-1B6SEH8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERVV-1B6SEH8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERVV-1B6SEH8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERVV-1B6SEH8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERVV-1B6SEH8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERVV-1B6SEH8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ERVV-1B6SEH8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERVV-1B6SEH8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERVV-1B6SEH8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERVV-1B6SEH8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ERVV-1B6SEH8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERVV-1B6SEH8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERVV-1B6SEH8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ERVV-1B6SEH8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERVV-1B6SEH8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERVV-1B6SEH8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERVV-1B6SEH8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERVV-1B6SEH8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ERVV-1B6SEH8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERVV-1B6SEH8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERVV-1B6SEH8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERVV-1B6SEH8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERVV-1B6SEH8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERVV-1B6SEH8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERVV-1B6SEH8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERVV-1B6SEH8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERVV-1B6SEH8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ERVV-1B6SEH8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERVV-1B6SEH8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERVV-1B6SEH8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERVV-1B6SEH8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ERVV-1B6SEH8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERVV-1B6SEH8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERVV-1B6SEH8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERVV-1B6SEH8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ERVV-1B6SEH8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERVV-1B6SEH8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERVV-1B6SEH8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ERVV-1B6SEH8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERVV-1B6SEH8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERVV-1B6SEH8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERVV-1B6SEH8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERVV-1B6SEH8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ERVV-1B6SEH8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERVV-1B6SEH8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ERVV-1B6SEH8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ERVV-1B6SEH8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
ERVV-1B6SEH8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms