Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF879B4DU55 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF879B4DU55 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF879B4DU55 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF879B4DU55 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF879B4DU55 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF879B4DU55 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF879B4DU55 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF879B4DU55 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF879B4DU55 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF879B4DU55 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF879B4DU55 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF879B4DU55 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF879B4DU55 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF879B4DU55 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF879B4DU55 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms