Protein–RNA interactions for Protein: A6NLX3

SPDYE4, Speedy protein E4, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE4A6NLX3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SPDYE4A6NLX3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPDYE4A6NLX3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPDYE4A6NLX3 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SPDYE4A6NLX3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPDYE4A6NLX3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPDYE4A6NLX3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPDYE4A6NLX3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPDYE4A6NLX3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPDYE4A6NLX3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPDYE4A6NLX3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPDYE4A6NLX3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPDYE4A6NLX3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPDYE4A6NLX3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPDYE4A6NLX3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPDYE4A6NLX3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPDYE4A6NLX3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPDYE4A6NLX3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPDYE4A6NLX3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPDYE4A6NLX3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPDYE4A6NLX3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPDYE4A6NLX3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPDYE4A6NLX3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPDYE4A6NLX3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPDYE4A6NLX3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPDYE4A6NLX3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPDYE4A6NLX3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPDYE4A6NLX3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPDYE4A6NLX3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SPDYE4A6NLX3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPDYE4A6NLX3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPDYE4A6NLX3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPDYE4A6NLX3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPDYE4A6NLX3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPDYE4A6NLX3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPDYE4A6NLX3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPDYE4A6NLX3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPDYE4A6NLX3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPDYE4A6NLX3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPDYE4A6NLX3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPDYE4A6NLX3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPDYE4A6NLX3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPDYE4A6NLX3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPDYE4A6NLX3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPDYE4A6NLX3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPDYE4A6NLX3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPDYE4A6NLX3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms