Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LIPT2A6NK58 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LIPT2A6NK58 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LIPT2A6NK58 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LIPT2A6NK58 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LIPT2A6NK58 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LIPT2A6NK58 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LIPT2A6NK58 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LIPT2A6NK58 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LIPT2A6NK58 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LIPT2A6NK58 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LIPT2A6NK58 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms